produkty

Nealkoholické ztučnění jater (NAFLD) má široké spektrum chorobných stavů od mírné steatózy charakterizované abnormální retencí lipidů v jaterních buňkách až po steatohepatitidu (NASH) vykazující hromadění tuku, zánět, balony a degradaci hepatocytů a fibrózu.V konečném důsledku může steatohepatitida vyústit v cirhózu jater a hepatocelulární karcinom. V této studii jsme analyzovali tři různé myší kmeny, A/J, C57BL/6J a PWD/PhJ, které vykazují různé stupně steatohepatitidy při podání 3,5-diethoxykarbonylu. Dieta obsahující -1,4-dihydrokolidin (DDC).Analýza genové exprese RNA-Seq, analýza proteinů a metabolické profilování byly použity k identifikaci odlišně exprimovaných genů/proteinů a narušených hladin metabolitů ve vzorcích myších jater po léčbě DDC.Analýza dráhy odhalila změnu metabolismu kyseliny arachidonové (AA) a S-adenosylmethioninu (SAMe) na jiných drahách.Pro pochopení metabolických změn metabolismu kyseliny arachidonové ve světle profilů exprese onemocnění byl vyvinut a optimalizován kinetický model této dráhy podle hladin metabolitů.Následně byl model použit ke studiu in silico účinků potenciálních cílů léčiv pro steatohepatitidu. Metabolismus AA/eikosanoidů jsme identifikovali jako vysoce narušený u myší indukovaných DDC pomocí kombinace experimentálního a in silico přístupu.Naše analýza metabolické dráhy AA/eikosanoidu naznačuje, že kyselina 5-hydroxyeikosatetraenová (5-HETE), kyselina 15-hydroxyeikosatetraenová (15-HETE) a prostaglandin D2 (PGD2) jsou u DDC myší narušeny.Dále demonstrujeme, že dynamický model lze použít pro kvalitativní predikci metabolických změn na základě transkriptomických dat v kontextu souvisejícím s onemocněním.Kromě toho byl metabolismus SAMe identifikován jako narušený v důsledku léčby DDC.Několik genů a také některé metabolity tohoto modulu vykazují rozdíly mezi A/J a C57BL/6J na jedné straně a PWD/PhJ na straně druhé.