produkty

Infračervená spektroskopie byla použita k mapování interakcí substrát-protein: konformační změny Ca(2+)-ATPázy sarkoplazmatického retikula po vazbě nukleotidu a fosforylaci ATPázy byly sledovány pomocí substrátu ATP a analogů ATP (2'-deoxy-ATP, 3 '-deoxy-ATP a inosin-5'-trifosfát), které byly modifikovány na specifických funkčních skupinách substrátu.Modifikace 2'-OH, 3'-OH a aminoskupiny adeninu snižují rozsah konformační změny ATPázy indukované vazbou, přičemž zvláště silné účinky byly pozorovány u posledně jmenovaných dvou.To demonstruje strukturální citlivost komplexu nukleotid-ATPáza na jednotlivé interakce mezi nukleotidem a ATPázou.Všechny studované skupiny jsou důležité pro vazbu a interakce dané ligandové skupiny s ATPázou závisí na interakcích jiných ligandových skupin.Fosforylace ATPázy byla pozorována pro ITP a 2'-deoxy-ATP, ale ne pro 3'-deoxy-ATP.Neexistuje žádná přímá souvislost mezi rozsahem konformační změny po vazbě nukleotidu a rychlostí fosforylace, což ukazuje, že plný rozsah ATP-indukované konformační změny není pro fosforylaci povinný.Jak bylo pozorováno u komplexu nukleotid-ATPáza, konformace prvního fosforylovaného meziproduktu ATPázy E1PCa(2) také závisí na nukleotidu, což ukazuje, že stavy ATPázy mají méně jednotnou konformaci, než se dříve očekávalo.